Koja tegevuse eesmärgid on:
· proviisorite huvide esindamine ja kaitse;
· proviisori elukutse väärtustamine;
· tervishoiupõhimõtetele vastava jätkusuutliku ning sõltumatu apteegikorralduse eest seismine;
· apteegiteenuse arendamine, selle kättesaadavuse ja kvaliteedi parandamine;
· apteegiteenuse tunnustamine tervishoiuteenusena